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本酶催化的反应为(1) L-Tryptophan + FADH2 + Chloride + O2 + H+ = 6-Chloro-L-Tryptophan + FAD + 2 H2O;;(2) D-Tryptophan + FADH2 + Chloride + O2 + H+ = 6-Chloro-D-Tryptophan + FAD + 2 H2O，系统名称为L-Tryptophan:FADH2 Oxidoreductase (6-Halogenating)，该酶是一种黄素依赖卤化酶，已见描述于若干细菌物种。它利用分子氧氧化 FADH2 辅因子，生成 C4a-氢过氧黄素，后者再与氯化物反应生成次氯酸根离子。次氯酸根与活性位点赖氨酸反应生成氯胺，后者使底物氯化。参见 EC 1.14.19.58（色氨酸 5-卤化酶）和 EC 1.14.19.9（色氨酸 7-卤化酶）。
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