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本酶催化的反应为(3Z)-Phycocyanobilin + 4 Oxidized Ferredoxin = Biliverdin IXalpha + 4 Reduced Ferredoxin，系统名称为(3Z)-Phycocyanobilin:ferredoxin Oxidoreductase，催化胆绿素IXα的四电子还原（A环和D环各进行两电子还原）。反应通过可分离的两电子中间体181,182-二氢胆绿素进行。黄素氧还蛋白可替代铁氧还蛋白。在蓝藻集胞藻属（Synechocystis sp.）PCC 6803、鱼腥藻属（Anabaena sp.）PCC7120和点形念珠藻（Nostoc punctiforme）中，胆绿素IXα（BV）直接转化为(3Z)-藻蓝胆素（PCB），这与红藻 Cyanidium caldarium 中提出的PCB生物合成途径（涉及(3Z)-藻红胆素（PEB）作为中间体 [2]）以及绿藻 Mesotaenium caldariorum 中PCB是可分离中间体的途径形成对比。
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