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本酶催化的反应为(1) 2 S-Adenosyl-L-Methionine + Adenine2503 In 23S RRNA + 2 Reduced [2Fe-2S] Ferredoxin = S-Adenosyl-L-Homocysteine + L-Methionine + 5'-Deoxyadenosine + 2-Methyladenine2503 In 23S RRNA + 2 Oxidized [2Fe-2S] Ferredoxin;;(2) 2 S-Adenosyl-L-Methionine + Adenine37 In TRNA + 2 Reduced [2Fe-2S] Ferredoxin = S-Adenosyl-L-Homocysteine + L-Methionine + 5'-Deoxyadenosine + 2-Methyladenine37 In TRNA + 2 Oxidized [2Fe-2S] Ferredoxin，系统名称为S-Adenosyl-L-Methionine:23S RRNA (Adenine2503-C2)-Methyltransferase，含有一个 [4Fe-4S] 簇 [2]。该酶是 "AdoMet radical"（radical SAM）家族的成员。S-腺苷-L-蛋氨酸既充当自由基发生器，又是所添加甲基的来源。RlmN 首先将一个 CH2 基团转移到一个保守的半胱氨酸（大肠杆菌 Escherichia coli 中为 Cys355）[6]，随后由第二个 S-腺苷-L-蛋氨酸产生的自由基进攻该甲基并夺取一个氢。所形成的自由基与 tRNA 的腺嘌呤基团形成共价中间体 [9]。RlmN 是细胞用来优化核糖体蛋白质合成功能的内源性酶 [2]。该酶通过自由基机制以 S-腺苷-L-蛋氨酸的 CH2 对 23S rRNA 腺苷2503 的 C-2 位进行甲基化并保留该位上的氢。它还能甲基化 23S rRNA 的 8-甲基腺苷2503。参见 EC 2.1.1.224（23S rRNA (腺嘌呤2503-C8)-甲基转移酶）。
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