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本酶催化的反应为S-Adenosyl-L-Methionine + Malonyl-[Acyl-Carrier Protein] = S-Adenosyl-L-Homocysteine + Malonyl-[Acyl-Carrier Protein] Methyl Ester,系统名称为S-Adenosyl-L-Methionine:malonyl-[Acyl-Carrier Protein] O-Methyltransferase,参与革兰氏阴性菌生物素生物合成的早期步骤。该酶催化将一个甲基转移到丙二酰-[酰基载体蛋白]的 ω-羧基上形成甲酯。该甲酯被脂肪酸合成酶识别,并通过脂肪酸延长循环被加工为庚二酰-[酰基载体蛋白]甲酯 [5]。虽然该酶也可接受丙二酰-CoA,但它对丙二酰-[酰基载体蛋白]的活性要高得多 [6]。