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本酶催化的反应为S-Adenosyl-L-Methionine + [Protein]-L-Arginine = S-Adenosyl-L-Homocysteine + [Protein]-Nomega-Methyl-L-Arginine，系统名称为S-Adenosyl-L-Methionine:[protein]-L-Arginine N-Methyltransferase ([Protein]-Nomega-Methyl-L-Arginine-Forming)，III型蛋白精氨酸甲基转移酶催化对蛋白内L-精氨酸残基胍基末端氮原子之一的单甲基化。与同样催化此反应的I型和II型蛋白精氨酸甲基转移酶不同，III型酶不再对底物进一步甲基化。参见 EC 2.1.1.319，I型蛋白精氨酸甲基转移酶，EC 2.1.1.320，II型蛋白精氨酸甲基转移酶，及 EC 2.1.1.322，IV型蛋白精氨酸甲基转移酶。
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