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本酶催化的反应为[Biotin Carboxyl-Carrier Protein]-N6-Carboxybiotinyl-L-Lysine + Acetyl-CoA = [Biotin Carboxyl-Carrier Protein]-N6-Biotinyl-L-Lysine + Malonyl-CoA，系统名称为[Biotin Carboxyl-Carrier Protein]-N6-Carboxybiotinyl-L-Lysine:acetyl-CoA:carboxytransferase，该酶催化将生物素羧基载体蛋白（BCCP）上由生物素携带的羧基转移给乙酰-CoA，生成丙二酰-CoA。在某些生物中，该活性是包含载体蛋白和 EC 6.3.4.14（生物素羧化酶）的多结构域多肽的一部分（见 EC 6.4.1.2，乙酰-CoA 羧化酶）。某些酶还可以羧化丙酰-CoA 和丁酰-CoA（参见 EC 6.4.1.3，丙酰-CoA 羧化酶）。
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