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本酶催化的反应为Malonyl-CoA + Pelargonidin 3-O-(6-Caffeoyl-beta-D-Glucoside) 5-O-beta-D-Glucoside = CoA + 4'''-Demalonylsalvianin，系统名称为Malonyl-CoA:pelargonidin-3-O-(6-Caffeoyl-beta-D-Glucoside)-5-O-beta-D-Glucoside 6'''-O-Malonyltransferase，对鼠尾草苷（salvianin）生物合成的倒数第二步特异。该酶也催化紫苏苷（shisonin）的丙二酰化生成丙二酰紫苏苷 [花青素3-O-(6''-O-对香豆酰-β-D-葡萄糖苷)-5-(6'''-O-丙二酰-β-D-葡萄糖苷)]。化合物4'''-脱丙二酰鼠尾草苷、鼠尾草苷、天竺葵素3,5-二葡萄糖苷和飞燕草素3,5-二葡萄糖苷不能作为底物。
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