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本酶催化的反应为Acetyl-CoA + An N-Terminal-L-Methionyl-[Transmembrane Protein] = An N-Terminal-Nalpha-Acetyl-L-Methionyl-[Transmembrane Protein] + CoA，系统名称为Acetyl-CoA:N-Terminal-Met-Lys/Ser/Val/Leu/Gln/Ile/Tyr/Thr-[Transmembrane Protein] Met-Nalpha-Acetyltransferase，N端乙酰转移酶（NAT）催化将来自乙酰-CoA的乙酰基共价连接到蛋白N末端的游离α-氨基上。这种不可逆修饰中和了N末端的正电荷，使N末端残基变大且更具疏水性，并防止其被水解去除。NatF仅存在于高等真核生物中，酵母中没有。与其他Nat系统不同，该酶位于高尔基体。它面向胞内膜的细胞质侧，专一乙酰化N末端朝向细胞质的跨膜蛋白。NatF靶向后接Lys、Ser、Val、Leu、Gln、Ile、Tyr和Thr残基的N末端L-甲硫氨酸残基。
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