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本酶催化的反应为[Protein]-Npi-Phospho-L-Histidine + alpha,alpha-Trehalose[side 1] = [Protein]-L-Histidine + alpha,alpha-Trehalose 6-Phosphate[side 2]，系统名称为Protein-Npi-Phospho-L-Histidine:alpha,alpha-Trehalose Npi-Phosphotransferase，该酶是磷酸烯醇丙酮酸（PEP）依赖性、转运糖的磷酸转移酶系统（PTS）的组分（称为酶II）。该系统仅存在于原核生物中，在将底物从周质空间或胞外空间转运到细胞质的同时将其磷酸化。各系统共享的磷酸供体是低分子量的磷酸载体蛋白，它已被 EC 2.7.3.9（磷酸烯醇丙酮酸---蛋白磷酸转移酶）磷酸化。而酶II对特定底物专一，尽管在某些情况下也可较低效率地转运替代底物。该反应涉及磷酸基团在酶内数个氨基酸之间连续转移，最后才转移到底物上。
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