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本酶催化的反应为Hydrolysis Of beta-D-Galactopyranose-(1->4)-alpha-L-Galactopyranose-6-Sulfate Linkages In Porphyran,系统名称为Porphyran beta-D-Galactopyranose-(1->4)-alpha-L-Galactopyranose-6-Sulfate 4-Glycanohydrolase,紫菜多糖的主链大部分(约 70%)由 (1->3) 连接的 β-D-吡喃半乳糖随后接 (1->4) 连接的 α-L-吡喃半乳糖-6-硫酸组成(其余 30% 主要为琼脂二糖重复单元,即 (1->3) 连接的 β-D-吡喃半乳糖随后接 (1->4) 连接的 3,6-脱水-α-L-吡喃半乳糖)[2]。该酶切割 β-D-吡喃半乳糖与 α-L-吡喃半乳糖-6-硫酸之间的 (1->4) 连接,主要生成二糖 α-L-吡喃半乳糖-6-硫酸-(1->3)-β-D-半乳糖,但也观察到一些偶数残基数目的较长寡糖。由于该酶对紫菜多糖主链中非硫酸化的琼脂糖部分无活性,产物中也包含一些琼脂糖片段 [1]。D-半乳糖的甲基化会阻止来自佐贝尔氏加利球菌 Zobellia galactanivorans 的酶在 -1 亚位点结合,但不影响来自 Wenyingzhuangia fucanilytica 的酶 [2,3]。