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本酶催化的反应为Xm-(1->4)-beta-D-GlcpN-(1->4)-beta-D-GlcpNAc-(1->4)-Xn + H2O = Xm-(1->4)-beta-D-GlcpN-(1->4)-alpha-D-GlcpNAc + Xn，系统名称为Partially Acetylated Chitosan Endo Glucsamino-N-Acetylglucosaminohydrolase (Configuration-Inverting)，该酶是一种内切水解酶，在部分乙酰化壳聚糖中的 GlcN-GlcNAc 二单元之后切割，亚位点 -2 对 GlcN 特异，亚位点 -1 对 GlcNAc 特异。该酶不切割完全脱乙酰化的壳聚糖（由壳聚糖酶（EC 3.2.1.132）和葡糖胺酶（EC 3.2.1.165）切割），也不切割完全乙酰化的几丁质（由几丁质酶（EC 3.2.1.14、EC 3.2.1.200、EC 3.2.1.201、EC 3.2.1.202）和 N-乙酰葡糖胺酶（EC 3.2.1.52）切割）。该蛋白在培养植物病原真菌 Alternaria alternata 的培养基中发现。
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