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本酶催化的反应为Strict Requirement For An Asp Residue At Positions P1 And P4. It Has A Preferred Cleavage Sequence Of Asp-Xaa-Xaa-Asp! With A Hydrophobic Amino-Acid Residue At P2 And A Hydrophilic Amino-Acid Residue At P3, Although Val Or Ala Are Also Accepted At This Position，半胱天冬酶-3 是一种效应/执行半胱天冬酶，与半胱天冬酶-6（EC 3.4.22.59）和半胱天冬酶-7（EC 3.4.22.60）同类 [5]。这些半胱天冬酶负责大多数细胞多肽的蛋白水解 [如聚(ADP-核糖)聚合酶（PARP）]，从而导致凋亡表型 [3,5]。前半胱天冬酶-3 可被半胱天冬酶-1（EC 3.4.22.36）、半胱天冬酶-8（EC 3.4.22.61）、半胱天冬酶-9（EC 3.4.22.62）和半胱天冬酶-10（EC 3.4.22.63）以及丝氨酸蛋白酶颗粒酶 B 激活 [1]。半胱天冬酶-3 可激活前半胱天冬酶-2（EC 3.4.22.55）[2]。激活通过结构域间切割并随后去除 N 端前结构域而发生 [6]。虽然 Asp-Glu-(Val/Ile)-Asp 被认为是偏好的切割序列，但该酶可容纳底物 P2 和 P3 位置上的不同残基 [4]。与半胱天冬酶-2 一样，半胱天冬酶-3 的 P5 位为疏水残基时水解效率更高，例如 (Val/Leu)-Asp-Val-Ala-Asp! 是比 Asp-Val-Ala-Asp! 更好的底物。半胱天冬酶-7 的情况则并非如此 [4]。属于肽酶家族 C14。
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