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本酶催化的反应为Citrate = Isocitrate (Overall Reaction);;(1a) Citrate = Cis-Aconitate + H2O;;(1b) Cis-Aconitate + H2O = Isocitrate,系统名称为Citrate(isocitrate) Hydro-Lyase (Cis-Aconitate-Forming),除在柠檬酸和顺式乌头酸之间互变外,它还使顺式乌头酸与异柠檬酸互变,因此使柠檬酸与异柠檬酸互变。平衡混合物为91%柠檬酸、6%异柠檬酸和3%乌头酸。顺式乌头酸用于指代异构体(Z)-丙-1-烯-1,2,3-三羧酸。一种铁硫蛋白,含有底物结合的[4Fe-4S]簇。