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本酶催化的反应为Eliminative Degradation Of Polysaccharides Containing 1,4-beta-D-Hexosaminyl And 1,3-beta-D-Glucuronosyl Linkages To Disaccharides Containing 4-Deoxy-beta-D-Gluc-4-Enuronosyl Groups，系统名称为Chondroitin AC Lyase，作用于软骨素4-硫酸和软骨素6-硫酸，但对透明质酸作用较差。一般来说，硫酸软骨素（CS）和硫酸皮肤素（DS）链包含连接区、链帽和重复区。CS的重复区是葡萄糖醛酸（GlcA）和N-乙酰半乳糖胺（GalNAc）的重复二糖[-4)GlcA(β1-3)GalNAc(β1-]n，可在GalNAc的C-4和/或C-6以及GlcA的C-2上O-硫酸化。CS的GlcA残基可差向异构化为艾杜糖醛酸（IdoA），形成DS的重复二糖[-4)IdoA(α1-3)GalNAc(β1-]n。硫酸酯取代基的浓度和位置都随葡萄糖胺聚糖来源而变化 [4]。
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